Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gcom1E9PZ54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gcom1E9PZ54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms