Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kpna7C0LLJ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms