Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms