Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apba1B2RUJ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms