Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms