Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc25a53A2AF28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms