Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms