Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ccdc18Q640L5 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc18Q640L5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc18Q640L5 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc18Q640L5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc18Q640L5 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms