Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Trim12aQ99PQ1 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Trim12aQ99PQ1 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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