Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxb2P0C1T1 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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