Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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OtofQ9ESF1 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
OtofQ9ESF1 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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