Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp4P35123 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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