Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek4Q9Z1J2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek4Q9Z1J2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms