Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb6Q9Z0T9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb6Q9Z0T9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms