Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn15Q9Z0S5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn15Q9Z0S5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn15Q9Z0S5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn15Q9Z0S5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms