Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PARP4Q9UKK3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP4Q9UKK3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms