Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb3Q9R1P1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb3Q9R1P1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms