Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf7Q9R1C0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf7Q9R1C0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms