Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trex2Q9R1A9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms