Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot9Q9JKY0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot9Q9JKY0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms