Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SyncQ9EPM5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SyncQ9EPM5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms