Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan4Q9DCK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms