Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms