Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhobtb1Q9DAK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms