Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syce1Q9D495 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms