Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Snx20Q9D2Y5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms