Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms