Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms