Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cnih4Q9CX13 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnih4Q9CX13 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cnih4Q9CX13 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnih4Q9CX13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cnih4Q9CX13 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms