Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms