Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms