Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms