Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms