Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms