Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed9Q99KF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms