Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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