Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn8Q91VA3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn8Q91VA3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms