Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms