Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
0610009B22RikQ8R3W2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms