Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms