Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm10600Q8BQ57 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10600Q8BQ57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm10600Q8BQ57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm10600Q8BQ57 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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