Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms