Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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