Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Katnb1Q8BG40 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms