Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Necab1Q8BG18 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Necab1Q8BG18 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms