Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms