Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms