Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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