Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil2Q6R2P8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms