Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trak1Q6PD31 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trak1Q6PD31 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms